応用AIエンジニア、臨床情報学—イーライリリー、ボストン勤務
イーライリリーの臨床試験、バイオバンク、トランスレーショナルメディシンプログラム向けに、応用AIと機械学習の能力を開発します。 臨床・分子・集団データを用いて患者表現型を特徴づけ、将来の治療法に向けたエビデンスを創出します。
仕事内容
- 研究者が自然言語で臨床データを検索できるエージェント型AIツールを作成し、実運用化する
- 生物医学オントロジー、試験レジストリ、精選されたパスウェイリソースを用いて、検索拡張生成の出力を検証済みの生物学的知識に基づかせる
- 教師なし学習と自己教師あり学習を適用し、試験およびバイオバンクデータセット全体から患者アーキタイプと分子疾患サブタイプを特定する
- 統合した臨床変数とオミクス変数から生存時間解析と動的治療レジーム推定器を構築する
- 多様な臨床試験およびバイオバンクのデータソースを共通データ表現に標準化する
- 導入後のモデル品質、安全性、運用信頼性を評価し、継続的に監視する
- リリーの研究プログラムを支援するベンダー、請負業者、外部パートナーを調整する
- 二次解析および探索的解析に使用する固定済み試験データベース向けに、SDTMおよびADaMベースのパイプラインを開発する
- 完了した試験を分析し、サブグループ効果、治療効果の異質性、レスポンダーとノンレスポンダーのパターンを検討する
- 有害事象の記述、臨床記録、治験責任医師のコメントに自然言語処理を適用し、潜在的な安全性シグナルを発見する
- 患者の縦断的な病歴を再構築し、疾患進行、治療反応の動態、イベント発生までの時間の評価項目を研究する
- 完了した臨床試験を横断する研究間メタ解析および統合ワークフローを設計する
- UK BiobankやAll of Usを含む大規模バイオバンクコホートを、外部検証とデータ拡充に活用する
- データバージョン管理、コンテナ化コンピューティング、監査対応の解析記録により再現可能な研究運用を実装する
- HIPAA、GDPR、適用されるIRBおよび倫理委員会の基準に従って研究を実施する
応募要件
- 生物医学情報学、計算生物学、バイオインフォマティクス、統計遺伝学、疫学、コンピュータサイエンス、または関連する定量分野の修士号、もしくは同等のトランスレーショナルデータサイエンスの専門性を持つMD/PhDを有し、臨床試験データセット（SDTM/ADaM）、バイオバンクデータ、または大規模な集団健康データセットを用いた研究経験が6年以上あること
- 生物医学情報学、計算生物学、バイオインフォマティクス、統計遺伝学、疫学、コンピュータサイエンス、または関連する定量分野の博士号、もしくは同等のトランスレーショナルデータサイエンスの専門性を持つMD/PhDを有し、臨床試験データセット（SDTM/ADaM）、バイオバンクデータ、または大規模な集団健康データセットを用いた研究経験が3年以上あること
- 臨床データ分析向けのAIツールを本番環境に導入した実績
- 機械学習および統計モデリングのための高度なPythonおよび/またはRスキル
- 高いSQLスキル
- クラウド研究コンピューティングプラットフォームの使用経験。DNAnexus、AWS、Google Cloud、Azure、または高性能コンピューティングクラスターの経験があれば望ましい
- LLMのファインチューニングや基盤モデルのゼロからの訓練を含む、高度な生成AI技術に関する実務知識
- 高性能コンピューティング環境での業務経験
- SDTMおよびADaMを含むCDISC標準に関する包括的な知識
- 臨床またはゲノム研究に生存時間解析、因果推論、自然言語処理、深層学習を適用した実績
- OMOP CDM、HL7 FHIR Genomics、および主要な生物医学オントロジーに関する深い理解
- UK BiobankやAll of Usを含む主要な公開およびアクセス制限付きバイオバンクを用いた実践的な研究経験
- 多施設生物医学研究に連合学習、差分プライバシー、またはセキュアコンピューティング手法を適用した経験
- 臨床AI、トランスレーショナルインフォマティクス、ゲノミクス、または関連分野における査読付き論文の実績
- ターゲットトライアルフレームワークと、バイオバンクデータへのその適用に関する知識
- ファーマコゲノミクス、薬物反応モデリング、または臨床試験のPK/PD解析に関する知識
- 生物医学ナレッジグラフの構築、グラフ機械学習の適用、またはオントロジーベース推論の使用経験
- マルチオミクスデータセットの分析経験
- HIPAA、GDPR、適用されるIRBおよび倫理委員会の要件を遵守できること
福利厚生
- 組織および個人の成果が一部反映される会社賞与の対象となる資格
- 雇用主拠出型401(k)プラン
- 年金制度
- 休暇
- 医療保障
- 歯科保障
- 眼科保障
- 処方薬保障
- 医療費および/または扶養家族介護費の柔軟な支出口座制度
- 生命保険および死亡給付
- 休暇および休業制度
- 従業員支援プログラム、フィットネスプログラム、従業員クラブや活動などのウェルビーイング支援
- 従業員リソースグループ